V konventu existovala snad již ve 13. století škola, na které studovali příslušníci řádu. V písemných pramenech však zmíněna není. Řádová škola (studium generale) mělo u sv. Klimenta vzniknout již počátkem 14. století, tehdy však z tohoto záměru nakonec sešlo.
Situace se změnila až s přípravou založení pražské univerzity, kdy v roce 1347 bylo na žádost Karla IV. studium generale zřízeno. Studium generale bylo pověstné vysokou úrovní, odpovídající soudobým zahraničním univerzitám, a stalo se předstupněm pražské univerzity, založené Karlem IV. roku 1348. Někteří dominikáni současně s příslušníky několika dalších řeholních řádů na teologické fakultě nově založené pražské univerzity přednášeli. K organizaci studia vyslala generální kapitula mistra teologie Jana z Dambachu, který se v Praze zdržel jen krátkou dobu. Roku 1348 byl jeho nástupcem jmenován jistý Lev a o rok později Martin Klatovský. Karel IV. také vymohl promování na stejnou akademickou hodnost pro dalšího dominikána – Jana Moravce.
Studium generale: www.staletapraha.cz/media/2017_2/sp-2017-2-cl-01-havrda-kovar-dominikansky-klaster-72dpi.pdf
Nejstarší univerzitní kodexy a Karel IV.
Nejstarší jádro historických fondů dnešní Národní knihovny tvoří rukopisy středověké pražské univerzity, jež byla založena Karlem IV. již roku 1348. Knihovny však neexistovaly při univerzitě jako celku či při jejích fakultách, ale při univerzitních kolejích, v nichž žili učitelé a studenti vysokého učení. Nejstarší a největší kolej, nazvaná Karlova po zakladateli univerzity, byla založena roku 1366. Zpočátku jí bylo věnováno jen několik desítek knih, avšak záhy, roku 1370, ji Karel nadal velkorysým darem: 114 rukopisy z pozůstalosti vyšehradského probošta Viléma z Lestkova, kterou předtím získal nemalým nákladem 100 hřiven stříbra. Z těchto rukopisů se na základě středověkých knihovních katalogů podařilo identifikovat tři kodexy: XIII F 12 (Johannis de Tambaco De culpa et gratia), VIII H 32 (Macrobius in Sompnum Scipionis) a XIII D 7 (Jacobi de Vitriaco Historia Hiersolymitana).
Tři nejstarší univerzitní kodexy z daru Karla IV., fond NK ČR, foto: Ivan Král