Sekce generálního ředitele zahrnuje útvar řízený náměstkem, dva samostatné referáty a tři odbory.
Úsek náměstka pro vědu, výzkum a mezinárodní vztahy
Referát bezpečnosti, krizového řízení a dislokace
Referát interního auditu
Kancelář generálního ředitele
Odbor komunikace
Odbor Historické a hudební fondy